Construção de transição do românico para o gótico. Construído durante o reinado de D.Afonso II (1218-1223) estava no entanto programado desde 1176. Seria D.Afonso II quem dará um maior incentivo À construção do Claustro até porque pretendia que os restos mortais do Chanceler Julião Pais fossem aí depositados. Será neste Claustro que funcionará a primeira escola episcopal de Portugal. É também aqui que está a arca tumular de D.Sizenando Davides, conquistador da cidade em 1064 e responsável pela construção de inúmeras igrejas na diocese coimbrã. É o mesmo D.Sizenando que funda o Cabido da Sé em 1080. Em cada galeria existem dois arcos geminados de volta perfeita envolvidos por um arco maior ogival. A servir de transição entre o arco ogival e o arco românico estão rosáceas, todas elas distintas.